Najłatwiej jest uzyskać kiełki z ziaren soczewicy, fasoli mung, lucerny czy rzodkiewki, natomiast kłopoty mogą sprawić nam kiełki soi, gorczycy, ciecierzycy oraz siemienia lnianego – ich nasiona podczas kiełkowania wytwarzają śluz, przez co hodowla wymaga częstego płukania (3-4 razy dziennie).
Kiełki słonecznika są dosyć podatne na gnicie – przyczyną jest cienka błonka pokrywająca nasiona, której możemy próbować się pozbyć po odmoczeniu ziaren. Z tego względu kiełki umieszczamy w lodówce zaraz po tym jak większość nasion się otworzy.